Et subdomæne er en selvstændig underafdeling af et domæne, fx blog.eksempel.dk eller shop.eksempel.dk – i modsætning til en undermappe som eksempel.dk/blog/.
Det klassiske SEO-spørgsmål er subdomæne eller undermappe: Google siger, begge dele fungerer, men erfaringen peger på, at undermapper deler autoritet mest direkte med hoveddomænet. Subdomæner vælges typisk af tekniske grunde – separate systemer, sprog eller apps.